KDEL, GFP, KKXX

[alixpa]

Salut !!

Je suis un peu perdue avec toute la partie du cours sur les vésicules COPI avec les motifs KDEL, GFP, KKXX... Est-ce qu'il serait possible de m'éclairer ?

Bonne journée et merci pour tout ce que vous faites <3

[Amatheia]

Salut alixpa !

Nous allons reprendre toutes ces notions ensemble.

Déjà, retiens bien que le mécanisme de formation des vésicules COP I est très similaire à celui des vésicules COP II. Ce sont simplement des protéines différentes qui vont entrer en jeu.

Les vésicules COP I vont permettre deux "sortes" de trafic :

• Du trafic antérograde au niveau de l'Appareil de Golgi. En effet, ce sont elles qui vont permettre de transporter des protéines du CIS golgi vers les autres citernes de l'organite.

• Du trafic rétrograde, c'est en fait une fonction de recyclage. En effet, tu sais que les protéines résidentes du RE doivent impérativement rester dans le RE car c'est là qu'elles exercent leurs fonctions. Les vésicules COP II vont sélectionner le contenu à emmener vers le Golgi, mais elles ne vont pas exclure les protéines qui doivent rester dans le RE. Ainsi, il existe une fuite de protéines normalement résidentes du RE vers l'appareil de Golgi. Le rôle des vésicules COP I va être de ramener ces protéines dans le RE, on dit qu'elles vont recycler les protéines résidentes du RE.

Maintenant, comment se font ces mécanismes de recyclage

Afin de ramener les protéines exportées vers le Golgi alors qu'elles ne devraient pas vers le RE, il va d'abord falloir pouvoir les identifier. Cela va être possible grâce à un motif présent sur ces protéines résidentes du RE : le motif KDEL. C'est un motif composé de 4 acides aminés (que le professeur ne détaille pas). Ce motif va être reconnu par des récepteurs KDEL puis tout le mécanisme de formation des vésicules COP I va se mettre en place, à l'image de celui des vésicules COP II avec un manteau interne et un manteau externe, puis ces vésicules COP I retourneront au RE.

Concernant la GFP, ce n'est pas un motif mais une protéine très utilisée en biologie. En effet, cette dernière est produite par des méduses et est fluorescente dans la cellule. C'est une protéine qui, normalement, est cytosolique.

Lorsqu'on modifie la GFP dans un laboratoire et qu'on lui ajoute un peptide signal et un motif KDEL, cette protéine va alors :

• être adressée vers le RE (grâce au peptide signal)

• devenir résidente du RE (grâce au motif KDEL qui va permettre à cette protéine de toujours revenir au RE)

Ainsi, la GFP modifiée au sein d'une cellule restera dans le RE. Cette protéine étant fluorescente, on pourra alors l'utiliser comme marqueur du RE : ce dernier deviendra alors fluorescent dû à la présence de la GFP.

Enfin, le motif KKXX a exactement le même rôle que le motif KDEL mais dans le cas de protéines transmembranaires du RE, tandis que KDEL sera présent sur les protéines résidentes solubles du RE. Mais il me semble que cette notion de motif KKXX n'a pas été abordée cette année par le professeur Hourioux.

J'espère avoir répondu à ta question ! N'hésites pas à me relancer si ce n'est pas le cas.


Lâche rien, la team biocell t'envoie toute sa force ! ♥

[alixpa]

C'est super clair maintenant merci beaucoup