Salut Soufiane ! Je vais te faire un (long) résumé pour être sûre de rien oublier
Dans un exercice typique, tu as un tableau avec plusieurs AA, notamment ceux appartenant au peptide dont tu dois calculer le pHi.
Dans ce tableau, pour chaque AA, tu retrouves le pKa de sa fonction acide carboxylique (important pour l'acide aminé en C-term), de sa fonction amine (important pour l'acide aminé en N-term) et potentiellement de sa chaîne latérale (important pour les acides aminés ayant une chaîne latérale chargé).
Toutefois, ce qui n’est pas indiqué généralement, c’est la nature de la fonction retrouvée sur la chaîne latérale, c’est-à-dire si c’est une fonction acide ou amine. En effet les charges changent selon les fonctions, il faut les connaître pour remplir correctement ton tableau de pHi ! Du coup je te fais une petite liste, ce sera plus facile pour toi
Les AA chargés avec une fonctions
amine :
- Histidine
- Lysine
- Arginine
Les AA chargés avec une fonction
acide carboxylique :
- Glutamate
- Aspartate
Le calcul du pHi est déjà tombé au concours, n'hésite pas à aller voir la vidéo du tutorat sur la méthode si ce n'est pas très clair pour toi.
J'espère avoir été claire, hésite pas à me relancer si tu as encore des questions
Bon courage !! Toute la Biochteam est avec toi ! <3