Spectrométrie de masse

[pacesPomée]

Salut la team bioch'
J'aimerai avoir un point cour s'il vous plaît, je ne comprend pas vraiment la spectrométrie de masse dans le cour de peptides. Je ne comprend pas surtout le mécanisme, comment ça marche.
Merci

[Bulou]

Salut pacesPomée ! On est parti pour un petit point de cours sur la spectrométrie de masse !

Tout d'abord, nous allons fragmenter notre peptide via des collisions peu agressives avec un gaz inerte. Ces collisions permettent de couper une seule liaison peptidique au hasard de notre peptide. Nous obtenons alors deux fragments :
- Les fragments du côté N-term sont notés b
- Les fragments du côté C-term sont notés y

Nous allons répéter plusieurs fois cette opération afin d'obtenir tous les différents fragments possibles. `C'est la première pièce jointe.

Ensuite nous allons placer nos fragments dans le spectromètre. Celui-ci est composé de deux lamelles métalliques qui forment un pôle positif et un pôle négatif. Nos fragments, sous formes ionisées, sont accélérés entre les deux pôles. Chaque fragment, sous l'effet du champ électrique, va osciller à une fréquence bien particulière qui dépend de son rapport m/z.. Cf deuxième pièce jointe.

Nous allons alors choisir une fréquence d'oscillation précise afin que seul le fragment qui oscille à cette fréquence soit détecté. Ainsi, si nous connaissons sa fréquence d'oscillation, nous connaissons son rapport m/z.

On obtient alors un graphique :
- Sur l’axe des abscisses est représenté le rapport m/z
- Sur l’axe des ordonnées est représentée l’intensité du signal
- La masse m correspond au nombre en haut de chaque signal

Nous calculons alors la différence de masse entre deux pics. Cette différence correspond à la masse de l'acide aminé rajouté entre les deux fragments étudiés. Nous répétons ce calcul pour tous les fragments afin d'obtenir progressivement la séquence du peptide.

Voici un petit exemple sur le shéma : La différence de masse entre Y7 (828,5) et Y6 (699,5) correspond à la masse de l’acide
aminé E, autrement dit le glutamate.

Et voilà ! N'hésites pas si tout n'est pas encore clair pour toi ! La team bioch' te souhaite bon courage dans tes révisions !!