Ig coupure et fragment

[Zard]

Bonsoir,

Je n'arrive pas à bien comprendre la différence entre les fragments Fab et les fragments Fab'2 et également les coupures de la pepsine et de la papaine (hormis le fait que la pepsine coupe en avale de la papaine). Est-il possible de me l'expliquer s'il vous plait?

Je vous remercie

[Maël]

Salut Zard !
Les Ig sont composées de 4 chaînes :

• 2 chaînes lourdes formées de 4 domaines Ig dont un variable en N-term
• 2 chaînes légères composée de 2 domaines Ig dont un variable en N-term

Chaque chaîne lourde portant une chaîne légère via des ponts disulfures.
On trouve également des ponts disulfures entre les deux chaînes lourdes au niveau de la région charnière, c'est dans cette région que la pepsine et la papaïne vont agir.

coupure papaïne et pepsine.JPG (27.67 Kio) Consulté 1844 fois

Le clivage par la Papaïne va donner 3 fragment tandis que la pepsine va donner 2 fragments
Moyen mnémotechnique: 3 syllabes dans papaïne et 2 syllabes dans pepsine

• La Papaïne: Elle va cliver au dessus de la charnière, formant ainsi un fragment Fc et 2 fragment Fab.
• La Pepsine: Elle va cliver en dessous de la charnière, formant ainsi un fragment Fc et un fragment F(ab')2.

Fc fab fab2.png (22.91 Kio) Consulté 1844 fois

- Le fragment Fc (c pour cristallisable) désigne la réunion de la moitié C-term des deux chaînes lourdes (formée chacune de deux domaines CH).
- Le fragment Fab (ab pour antigene binding) désigne la réunion d'une chaîne légère et de la moitié N-term d'une chaine lourde (composée d'un domaine constant CH et d'un domaine variable VH).
-Le fragment F(ab')2 est composé de deux fragments Fab et d'un morceau de la région charnière qui les garde connectés.

Au final, la différence entre la pepsine et la papaïne est que la pepsine clive un peu plus bas, laissant ainsi un morceau de la charnière qui va garder les deux fragments Fab liés en un unique fragment F(ab')2.

Voila
Bon courage dans tes révisons, tu as tout le soutient de la team bioch <3