Saaluuut,
Alors je ne vois pas trop de quoi tu parles avec les energies de première et deuxième ionisation. En effet, le P. Allouchi en parle dans le cours d'atomistique pour former les cations, mais le P. Andres je crois pas
Par contre dans le cours sur les AA, le P. parle effectivement d'ionisation à plusieurs reprises, du coup je te fais un petit point sur ça très rapide, mais n'hésite pas à me dire si c'est pas assez complet ou pas ça du tt!

A pH neutre, les AA sont ionisés, on a donc une charge négative (COO-) et une charge positive (NH3+). Ce
sont des espèces
amphotères : les AA portent à la fois un acide et une base.
En effet,
- à pH > 2, le COOH va se déprotonner et devenir le COO-
- à pH < 9, le NH3+ est sous forme ionisé
Ainsi, à un pH inférieur à 2, l'AA a une charge globale positive, et à pH supérieur à 9, l'AA a une charge globale négative.
Je sais pas du tt si cela t'aide, donc reformule moi ta question si ce n'est pas le cas.
Voila, bon courage de toute la team bioch <333