Annales 2021

[RomanC]

Salut la Bioch,
Concernant l'item B du QCM 31 de l'annale de 2021 qui est vrai : "la liaison peptidique s'établit toujours entre une amine primaire et un acide carboxylique"
Cela veut dire que la Proline change de conformation quand elle est lié à un autre acide aminé ?
Merci d'avance et bon weekend
Roman

[briana]

Salut Roman !

J'espère que tes révisions se passent bien !

Très bonne question de ta part ! Etant donné que le professeur Andrès n'a pas abordé le cas de figure de la proline, j'ai mené mes petites recherches perso.


La proline est effectivement le seul acide aminé cyclique, forme très particulière qui implique la création d'un coude "proline" de la chaîne protéique. Sa chaîne latérale est nommée noyau pyrrolidine. Cela entraîne une rigidité de la chaîne qui fait qu'elle ne peut plus tourner, elle est immobilisée.

proline.png (138.23 Kio) Consulté 4819 fois

Maintenant, ca n'empêche pas la proline d'être impliquée dans une liaison peptidique comme tout autre acide aminé. Elle établit une liaison peptidique entre son groupement amine primaire NH2+ avec un COOH d'un autre acide aminé. Et d'autre part, elle peut aussi établir une liaison peptidique entre son groupement COOH acide carboxilique et une amine primaire d'un autre AA.

En bref: Non, la proline n'a pas besoin et ne peut pas dans tous les cas changer de configuration pour établir une liaison peptidique avec un autre AA.

Je te mets un petit exemple illustratif juste en dessous:

proline bis.png (19.68 Kio) Consulté 4819 fois

J'espère que ma réponse a été suffisament claire, j'ai fait au mieux étant donné que le prof n'aborde pas ce point. Si tu as d'autres questions n'hésite surtout pas c'est le moment

L'équipe de Biochimie 2022 te souhaite bon courage pour la fin, donne tout !!!

[RomanC]

Merci pour ta réponse, mais je ne comprends pas pourquoi l'amine de la proline est considéré comme primaire étant donnée qu'il est lié à deux autres carbones ?
Merci pour vos encouragements

[briana]

Tu as effectivement raison, j'ai oublié de le préciser.

A retenir: La proline est le seul acide aminé qui comporte une fonction amine secondaire et non pas primaire.

Cependant, la règle pour la formation de la liaison peptidique s'applique quand même. Ici, la liaison peptidique se fera entre l'amine secondaire de la proline et une fonction acide carboxylique COOH d'un autre A.A.

Pour rappel:

Une amine primaire est sous forme NH2
Une amine secondaire est sous forme NHR
Une amine tertiaire est sous forme NR2

amines.png (47.07 Kio) Consulté 4794 fois

Voilààà j'espère avoir été plus claire avec ce petit complément d'info !

Bonne journée à toi