Hellooooo Léooo
Effectivement c’est une nouvelle notion cette année : le
séquençage nouvelle génération = NGS (aussi appelé séquençage de haut débit), on va faire un petit point
D’abord, à quoi elle sert ?
C’est une méthode de séquençage
moderne et bien plus
efficace que celles qu’on connaissait avant. Elle permet d’étudier non pas un gène mais tous les gènes en même temps et ainsi avoir une vision d’ensemble sur le génome : on peut alors identifier les
mutations des gènes, leur
niveau d’expression.
-> C’est une analyse à la fois
quantitative et
qualitative de l’
ADN, mais aussi de l’
ARN.
Ensuite, comment elle est réalisée ?
Deux méthodes différentes :
Pour l’ADN
Etape 1 : fragmenter l’ADN de façon
aléatoire
Etape 2 : séquencer chaque brin de l’ADN
Si on effectue le séquençage d’une
cellule humaine (génome connue), l’ordinateur va
comparer les fragments séquencés aux segments de
référence pour faire apparaître les mutations
Si on effectue le séquençage d’un
génome inconnu, la segmentation aléatoire du génome va permettre de reconstituer le génome grâce aux
zones chevauchantes (l’ordinateur reconnait les zones similaire et les superpose, on obtient ainsi le génome qui permet de caractériser un nouvel organisme
)
Il y a une utilité non négligeable de ce type de séquençage dans la
recherche, afin de découvrir et référencer des nouveaux génomes, mais aussi dans le
champ thérapeutique notamment pour les cancers.
Pour l’ARN
C‘est les mêmes étapes, mais en plus de pouvoir étudier les mutations, on peut obtenir des informations sur le
niveau d’expression des gènes, en quantifiant les ARNm, ce qu'on ne peut pas étudier sur l'ADN.
J'espère que ça a répondu à tes questions, hésite pas à nous redire si il y a quelque chose de pas clair !!
Bon courage et pleins de bisoussssss
